Hipospadias tedavisi cerrahidir ve özellikle uzmanlık gerektiren bir cerrahidir. İdrar yapısı itibariyle oldukça hassas olduğu için, ameliyat sonrası komplikasyon oranları oldukça yüksektir. Bu nedenle, ameliyatın mutlaka tecrübeli ellerde yapılması gereklidir. Cerrahiden başka, ameliyatsız herhangi bir tedavi seçeneği bulunmamaktadır.